В большой миске взбить вместе яйца, молоко, масло, муку, соль и перец до однородности (чтобы не было комочков). Раскрошить сыр (чтобы был небольшими кусочками), вмешать в тесто вместе с тимьяном. Полученное тесто охладить в холодильнике (от 2-х часов до суток).
Духовку разогреть до 220 С. Формочки для маффинов смазать сливочным или растительным маслом. Наполнить каждую формочку почти доверху и выпекать до золотистой корочки около 20 минут (в зависимости от размера формочек). Подавать теплыми.